Lisboa, Portugal, 11 e 12 maio de 2016. Sua Alteza fez uma visita oficial de dois dias a Lisboa. Durante a visita reuniu-se com o Presidente da República, Sua Excelência Marcelo Rebelo de Sousa, bem como vários altos funcionários do Governo, incluindo Sua Excelência, o Primeiro Ministro António Costa, Sua Excelência, o Presidente do Parlamento, o Sr. Eduardo Ferro Rodrigues e o Ministro dos Negócios Estrangeiros, Sua Excelência, o Sr. Augusto Santos Silva.
Durante a visita, o Ministério da Ciência, da Tecnologia e da Educação Superior da República Portuguesa e o Imamat Ismaili assinaram um acordo de cooperação para reforçar a capacidade de investigação e melhorar a qualidade de vida em Portugal e nos países de expressão portuguesa, em especial em África. Esta iniciativa vai contar com um empréstimo do Imamat Ismaili de 10 milhões durante 10 anos.
Esta é a primeira visita oficial de Sua Alteza o Aga Khan a Portugal após a entrada em vigor do Acordo entre a República Portuguesa e o Imamat Ismaili para o estabelecimento da Sede do Imamat Ismaili em Portugal em novembro de 2015. O acordo marcante constrói-se sobre uma série de acordos anteriores que remontam ao primeiro Protocolo de Cooperação assinado em 2005, e uma longa relação com o país que se estende por várias décadas.