En République kirghize, le programme de santé a pour objectif de renforcer l'état de santé des communautés des régions de montagne isolées du pays en améliorant l'accès à des soins de santé de qualité au niveau local et en faisant progresser la valorisation de la santé, en se concentrant notamment sur les femmes en âge de procréer et les enfants de moins de cinq ans. Les principales orientations stratégiques du programme de santé comprennent la valorisation de la santé communautaire, le renforcement des capacités des professionnels et des promoteurs de la santé et l'amélioration des prestations de services en matière de santé.
À ce jour, la Fondation Aga Khan (AKF) a, par l'intermédiaire du Programme de soutien au développement des communautés des régions de montagne (MSDSP), soutenu la création de 84 comités villageois pour la santé et de 64 comités scolaires pour la santé.
Les communautés de haute montagne ont généralement un régime alimentaire pauvre et souffrent d'importantes carences en micronutriments. Pour pallier ce problème, le MSDSP soutient la création de potagers dans ses zones d'action. Ainsi, 17 groupes de maraîchers ont été créés au profit de plus de 200 ménages.
Afin d'améliorer les soins prénataux et postnataux et d'accroître le soutien et la mobilisation des familles et des communautés pour améliorer la santé maternelle et infantile, le programme de santé a appuyé la création et l'exploitation de 24 écoles de préparation à la naissance (écoles des parents) dans les zones reculées des oblasts de Naryn et d'Osh.
Les écoles des parents sensibilisent les nouvelles et futures mères à l'importance de l'allaitement maternel, de la nutrition, de la prévention de l'anémie, des signes d'alerte en cours de grossesse et de la participation du père à la grossesse et au développement de l'enfant. En outre, depuis 2011, l'AKF met en avant son approche de soins pour le développement de l'enfant. Ainsi, plus de 200 promoteurs de la santé communautaire, dont des professionnels en soins de santé primaires, ont été formés aux soins pour le développement de l'enfant, atteignant au total 1 844 nourrices.
Dans les établissements de santé soutenus par l'AKF/MSDSP, plus de 22 000 personnes des oblasts de Naryn et d'Osh ont été sensibilisées à l'importance de la santé et de la prévention des maladies sur la santé reproductive, la planification familiale, les soins prénataux et postnataux, les soins pour le développement de l'enfant, la nutrition et l'approvisionnement en eau, l'assainissement et l'hygiène.
La Fondation Aga Khan (AKF) tire parti du potentiel des nouvelles technologies afin d'améliorer l'accès à des soins de santé de qualité dans les zones rurales de la République kirghize.
Le programme de santé a également pour but de renforcer les installations sanitaires existantes en favorisant le perfectionnement professionnel des prestataires de soins de santé et en améliorant l'accès aux services médicaux.
En 2016, le Service de santé Aga Khan, République kirghize a lancé son premier centre de médecine familiale et de diagnostic à Naryn. Ce centre propose des services ambulatoires et de diagnostic de haute qualité aux communautés de l'oblast de Naryn et des zones avoisinantes, ainsi qu'au corps enseignant, au personnel et aux étudiants de l'Université d'Asie centrale (UCA).
Jusqu'à présent, les retours ont été encourageants et le Centre a lancé des services de microbiologie en 2017, une première dans la région.